Protein–RNA interactions for Protein: Q494X3

ZNF404, Zinc finger protein 404, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404Q494X3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF404Q494X3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF404Q494X3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF404Q494X3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF404Q494X3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms