Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 TIM23YNR017W 669 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 SME1YOR159C 285 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YPR142CYPR142C 564 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 TEC1YBR083W 1461 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 TRS23YDR246W 660 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RRT5YFR032C 870 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MRPL25YGR076C 474 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YJR149WYJR149W 1215 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YBL036CYBL036C 774 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RUF22RUF22 515 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RFA2YNL312W 822 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YOR024WYOR024W 324 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 PBI1YPL272C 1554 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MTF2YDL044C 1323 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 KAR5YMR065W 1515 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MHR1YDR296W 681 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 PTI1YGR156W 1278 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 CLC1YGR167W 702 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MRPS17YMR188C 714 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 DHH1YDL160C 1521 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 GIC2YDR309C 1152 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 NCS6YGL211W 1080 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 UPF3YGR072W 1164 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 PCT1YGR202C 1275 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RPC25YKL144C 639 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MHT1YLL062C 975 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 IRC25YLR021W 540 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 GMC2YLR445W 567 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 TOM7YNL070W 183 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YNL140CYNL140C 570 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 MDH2YOL126C 1134 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 ODC2YOR222W 924 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 SWC5YBR231C 912 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YDR132CYDR132C 1488 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 TAH18YPR048W 1872 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 ZAP1YJL056C 2643 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 ARO8YGL202W 1503 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RRG1YDR065W 1098 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YPI1YFR003C 468 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 DAM1YGR113W 1032 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 IMP3YHR148W 552 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 PTH1YHR189W 573 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 RPB4YJL140W 666 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 NTR2YKR022C 969 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 GMH1YKR030W 822 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YLR402WYLR402W 192 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-NL2Q12470 COX2Q0250 756 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 GCV3YAL044C 513 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 HMX1YLR205C 954 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 TRS31YDR472W 852 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YER137CYER137C 447 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 HIS2YFR025C 1008 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YPT6YLR262C 648 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 DLT1YMR126C 1029 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 PIN2YOR104W 849 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YOR152CYOR152C 771 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 GRX5YPL059W 453 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 ATG32YIL146C 1590 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YKR023WYKR023W 1593 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 SWD1YAR003W 1281 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 KTR7YIL085C 1554 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 IRC22YEL001C 678 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 DSD1YGL196W 1287 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YLR235CYLR235C 399 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 NSE3YDR288W 912 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 ECM1YAL059W 639 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YLR046CYLR046C 813 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 RRT8YOL048C 1029 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YJR124CYJR124C 1347 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 CRP1YHR146W 1398 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 SHM2YLR058C 1410 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 PPH21YDL134C 1110 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YDR094WYDR094W 336 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 AIM36YMR157C 768 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 ECM18YDR125C 1362 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 YHR131CYHR131C 2553 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 SEC12YNR026C 1416 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 RSC8YFR037C 1674 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-NL2Q12470 HSP31YDR533C 714 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 ERG26YGL001C 1050 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 RSR1YGR152C 819 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 LNP1YHR192W 837 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 LAC1YKL008C 1257 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 SPS4YOR313C 1017 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 SUI3YPL237W 858 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 PWR1PWR1 941 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 ABD1YBR236C 1311 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 MAK11YKL021C 1407 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 MDM31YHR194W 1740 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 LSB6YJL100W 1824 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 SPR3YGR059W 1539 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 RNA15YGL044C 891 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-NL2Q12470 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt8.2□□□□□ -1.1
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