Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP4F3Q08477 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4F3Q08477 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F3Q08477 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms