Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB4BP61018 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB4BP61018 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB4BP61018 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms