Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BGRP55822 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BGRP55822 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms