Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL28P46779 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL28P46779 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL28P46779 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL28P46779 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL28P46779 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL28P46779 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL28P46779 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL28P46779 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL28P46779 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL28P46779 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL28P46779 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL28P46779 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL28P46779 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms