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Protein–RNA interactions for Protein: P32343
SSH4, Protein SSH4, yeast
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579 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SSH4
P32343
IVY1
YDR229W
1362 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PIH1
YHR034C
1035 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YHR140W
YHR140W
720 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YJL213W
YJL213W
996 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PRS4
YBL068W
981 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
TPI1
YDR050C
747 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PUP2
YGR253C
783 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YJU2
YKL095W
837 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
RPR1
RPR1
369 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
RDL2
YOR286W
450 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
SGF73
YGL066W
1974 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PMT1
YDL095W
2454 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
SRP101
YDR292C
1866 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
CBT1
YKL208W
816 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
CCW12
YLR110C
402 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
VPS65
YLR322W
315 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
COS10
YNR075W
1125 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
IRC11
YOR013W
471 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
ECM2
YBR065C
1095 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
ARO10
YDR380W
1908 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
BDS1
YOL164W
1941 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
BPL1
YDL141W
2073 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YPQ2
YDR352W
954 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PTH2
YBL057C
627 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
HXT17
YNR072W
1695 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
CHL4
YDR254W
1377 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
LAT1
YNL071W
1449 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PET117
YER058W
324 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
AIM46
YHR199C
933 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YLR122C
YLR122C
378 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YOX1
YML027W
1158 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
RUP1
YOR138C
2016 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
YLL058W
YLL058W
1728 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
DCR2
YLR361C
1737 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
NOP7
YGR103W
1818 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
PDC5
YLR134W
1692 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
CDC10
YCR002C
969 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
TRP1
YDR007W
675 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
CIT2
YCR005C
1383 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SSH4
P32343
QCR6
YFR033C
444 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
CST26
YBR042C
1194 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
GNA1
YFL017C
480 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
YPL067C
YPL067C
597 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
NFS1
YCL017C
1494 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
SIT1
YEL065W
1887 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
MPE1
YKL059C
1326 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
RIX7
YLL034C
2514 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
SNF11
YDR073W
510 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
GTS1
YGL181W
1191 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
HNM1
YGL077C
1692 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
ERP5
YHR110W
639 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
URA1
YKL216W
945 nt
6.74
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
ATG18
YFR021W
1503 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
YGL072C
YGL072C
360 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
COS6
YGR295C
1146 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
RPL43A
YPR043W
279 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
YER152C
YER152C
1332 nt
6.73
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
YNL040W
YNL040W
1371 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
GUS1
YGL245W
2127 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
AFG3
YER017C
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6.71
□□□□□ -1.33
SSH4
P32343
SEC18
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P32343
MAL31
YBR298C
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SSH4
P32343
NMT1
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SSH4
P32343
UME1
YPL139C
1383 nt
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SSH4
P32343
YBL113C
YBL113C
2379 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
SNA3
YJL151C
402 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
YLR030W
YLR030W
792 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
YPQ1
YOL092W
927 nt
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□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
PMT3
YOR321W
2262 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
MSS51
YLR203C
1311 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
ECM7
YLR443W
1347 nt
6.71
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
SOH1
YGL127C
384 nt
6.7
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
YHM2
YMR241W
945 nt
6.7
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
DPM1
YPR183W
804 nt
6.7
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
HXT9
YJL219W
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SSH4
P32343
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YOR196C
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SSH4
P32343
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P32343
TOP3
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SSH4
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YNL313C
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SSH4
P32343
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P32343
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P32343
CYS3
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P32343
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YMR003W
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GET4
YOR164C
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6.68
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SSH4
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HIS7
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SPE4
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YML131W
YML131W
1098 nt
6.67
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
ADH5
YBR145W
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SSH4
P32343
YMR155W
YMR155W
1644 nt
6.67
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
CDC13
YDL220C
2775 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
YKR073C
YKR073C
321 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
HAL1
YPR005C
885 nt
6.66
□□□□□ -1.34
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P32343
ARO7
YPR060C
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6.66
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
IMA2
YOL157C
1770 nt
6.66
□□□□□ -1.34
SSH4
P32343
CDS1
YBR029C
1374 nt
6.66
□□□□□ -1.34
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