Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINGO3P0C6S8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO3P0C6S8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO3P0C6S8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO3P0C6S8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINGO3P0C6S8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms