Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRB1P04280 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRB1P04280 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRB1P04280 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRB1P04280 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRB1P04280 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRB1P04280 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRB1P04280 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRB1P04280 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRB1P04280 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRB1P04280 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRB1P04280 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRB1P04280 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRB1P04280 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB1P04280 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB1P04280 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB1P04280 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRB1P04280 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB1P04280 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB1P04280 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB1P04280 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRB1P04280 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB1P04280 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB1P04280 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB1P04280 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB1P04280 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRB1P04280 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRB1P04280 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRB1P04280 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB1P04280 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB1P04280 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB1P04280 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRB1P04280 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRB1P04280 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRB1P04280 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRB1P04280 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRB1P04280 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRB1P04280 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRB1P04280 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRB1P04280 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRB1P04280 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB1P04280 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRB1P04280 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms