Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIOO75962 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIOO75962 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIOO75962 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIOO75962 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIOO75962 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIOO75962 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIOO75962 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIOO75962 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIOO75962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIOO75962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIOO75962 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIOO75962 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIOO75962 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIOO75962 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIOO75962 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIOO75962 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOO75962 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOO75962 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIOO75962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIOO75962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIOO75962 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIOO75962 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOO75962 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOO75962 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOO75962 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIOO75962 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOO75962 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOO75962 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOO75962 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIOO75962 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOO75962 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOO75962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIOO75962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIOO75962 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOO75962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOO75962 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOO75962 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOO75962 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIOO75962 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIOO75962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIOO75962 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIOO75962 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOO75962 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOO75962 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOO75962 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOO75962 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIOO75962 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOO75962 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOO75962 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIOO75962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOO75962 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIOO75962 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOO75962 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOO75962 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOO75962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIOO75962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOO75962 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIOO75962 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIOO75962 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOO75962 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOO75962 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOO75962 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOO75962 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOO75962 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOO75962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOO75962 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms