Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC50.9■■■■■ 5.74
ABCC9O60706 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC50.86■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC50.86■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC50.85■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC50.83■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC9O60706 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC50.8■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC50.8■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.8■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC50.78■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC50.77■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC50.76■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC50.76■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC50.76■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC50.76■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC50.75■■■■■ 5.72
ABCC9O60706 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC50.75■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC50.74■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.71■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC50.69■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
ABCC9O60706 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC50.64■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCC9O60706 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC50.62■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCC9O60706 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC50.56■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC50.55■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
ABCC9O60706 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms