Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC18O15417 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC18O15417 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC18O15417 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC18O15417 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC18O15417 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRC18O15417 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms