Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOTOA8MTQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOTOA8MTQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.5 ms