Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC24CP53992 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms