Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms