Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms