Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRIP3Q6Q6R5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP3Q6Q6R5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms