Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SETD1BQ9UPS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SETD1BQ9UPS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SETD1BQ9UPS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SETD1BQ9UPS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SETD1BQ9UPS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SETD1BQ9UPS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.9 ms