Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF3Q9ULD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF3Q9ULD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRPF3Q9ULD4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
BRPF3Q9ULD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms