Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF20Q9UGU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF20Q9UGU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF20Q9UGU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCF20Q9UGU0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms