Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKIRAS1Q9NYS0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NKIRAS1Q9NYS0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKIRAS1Q9NYS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms