Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms