Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLN6Q9NWW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLN6Q9NWW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLN6Q9NWW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms