Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCND1Q9NSA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCND1Q9NSA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCND1Q9NSA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCND1Q9NSA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms