Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SMG1Q96Q15 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG1Q96Q15 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG1Q96Q15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMG1Q96Q15 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMG1Q96Q15 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
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