Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LMTK3Q96Q04 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LMTK3Q96Q04 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LMTK3Q96Q04 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LMTK3Q96Q04 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
LMTK3Q96Q04 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms