Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFRP2Q96HF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SFRP2Q96HF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP2Q96HF1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms