Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PRG4Q92954 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
PRG4Q92954 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRG4Q92954 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRG4Q92954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRG4Q92954 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRG4Q92954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms