Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATOH1Q92858 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATOH1Q92858 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATOH1Q92858 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATOH1Q92858 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATOH1Q92858 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATOH1Q92858 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms