Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL22A1Q8NFW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
COL22A1Q8NFW1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL22A1Q8NFW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL22A1Q8NFW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms