Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-212ENST00000608057 2036 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-204ENST00000452437 737 ntTSL 48.44□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-220ENST00000592723 458 ntTSL 48.07□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 AF279873.3-201ENST00000523063 766 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-211ENST00000407275 252 ntTSL 37.52□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-204ENST00000502481 473 ntTSL 47.36□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ADAMTS6-202ENST00000381052 6956 ntTSL 27.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 YLPM1-205ENST00000549293 5500 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 36.9□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HIBCH-209ENST00000416732 502 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HIBCH-205ENST00000409820 511 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-217ENST00000609106 2780 ntTSL 26.42□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PCM1-213ENST00000519802 796 ntTSL 26.1□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SNRNP40-205ENST00000486941 743 ntTSL 25.66□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CASC4-206ENST00000558847 622 ntTSL 35.56□□□□□ -1.525e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 35.37□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 AC087633.2-207ENST00000616940 698 ntTSL 55.33□□□□□ -1.565e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-211ENST00000607932 1827 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PCM1-220ENST00000523896 740 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 POT1-203ENST00000429326 579 ntTSL 54.9□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-212ENST00000433533 471 ntTSL 34.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SNRNP40-206ENST00000489853 1928 ntTSL 24.67□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PCM1-208ENST00000518877 316 ntTSL 34.51□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-225ENST00000480435 560 ntTSL 54.43□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.31□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-207ENST00000507310 683 ntTSL 34.17□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 28.86□□□□□ -0.999e-40■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.562e-11■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 TOMM7-205ENST00000483581 551 ntTSL 1 (best)2.96□□□□□ -1.942e-11■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PET100-207ENST00000623154 1815 nt21.52■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.12■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 514.57□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PET100-204ENST00000600836 474 ntTSL 311.07□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PET100-203ENST00000598540 375 ntTSL 35.24□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 32.3
LARP4Q71RC2 PRELID1-206ENST00000510701 435 ntTSL 24.45□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 ISOC2-208ENST00000591718 786 ntTSL 216.01■□□□□ 0.158e-9■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 RPL39-203ENST00000477403 405 ntTSL 34.87□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-202ENST00000414914 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-203ENST00000430798 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 57.46□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-206ENST00000470583 555 ntTSL 46□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 GLCCI1-207ENST00000474269 691 ntTSL 55.3□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 32.2
LARP4Q71RC2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.217e-8■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 IDH2-204ENST00000560061 1449 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 MRPL2-206ENST00000485654 428 ntTSL 211.94□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-201ENST00000330688 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-207ENST00000480001 1191 ntTSL 36.64□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-202ENST00000383772 1273 ntTSL 56.16□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-206ENST00000479097 1235 ntTSL 35.14□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 RARB-205ENST00000462272 1258 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 ANAPC16-203ENST00000478193 734 ntTSL 212.19□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 ANAPC16-202ENST00000470481 1828 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 32.1
LARP4Q71RC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 TMA7-203ENST00000479126 688 ntTSL 219.77■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 TMA7-202ENST00000477624 619 ntTSL 1 (best)19.12■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 USP25-209ENST00000547201 757 ntTSL 25.14□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 32
LARP4Q71RC2 USP25-210ENST00000549362 606 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 32
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 81.3 ms