Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LYSMD4Q5XG99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYSMD4Q5XG99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYSMD4Q5XG99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LYSMD4Q5XG99 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD4Q5XG99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms