Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIF1Q5UIP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIF1Q5UIP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIF1Q5UIP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIF1Q5UIP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms