Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFT2D3Q587I9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFT2D3Q587I9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms