Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMS2P11Q13670 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PMS2P11Q13670 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P11Q13670 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P11Q13670 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.2 ms