Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-11■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.876e-11■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 58.52□□□□□ -1.056e-11■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 SLC2A9-204ENST00000503280 584 ntTSL 44.67□□□□□ -1.666e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 SLC2A9-212ENST00000512342 967 ntTSL 34.64□□□□□ -1.676e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 SLC2A9-205ENST00000503803 644 ntTSL 34.37□□□□□ -1.716e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 HCG18-246ENST00000602591 1976 nt7.73□□□□□ -1.174e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.834e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-7■■■■□ 20.3
SRSF9Q13242 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 511.36□□□□□ -0.598e-7■■■■□ 20.3
SRSF9Q13242 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 58.17□□□□□ -1.18e-7■■■■□ 20.3
SRSF9Q13242 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 213.87□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-211ENST00000508303 2334 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-214ENST00000633239 1494 ntTSL 511.53□□□□□ -0.564e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-217ENST00000636644 544 ntTSL 511.16□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NANS-206ENST00000495319 764 ntTSL 311.11□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-207ENST00000475228 813 ntTSL 510.64□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-206ENST00000504803 1674 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NANS-205ENST00000480925 649 ntTSL 29.73□□□□□ -0.854e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-215ENST00000586268 830 ntTSL 39.22□□□□□ -0.935e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 DOCK6-202ENST00000585609 3152 ntTSL 29.05□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-209ENST00000477679 885 ntTSL 28.72□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ESPN-204ENST00000434576 750 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-216ENST00000587190 553 ntTSL 48.26□□□□□ -1.095e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.185e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-210ENST00000585323 381 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.185e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.235e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-207ENST00000505487 449 ntTSL 36.91□□□□□ -1.34e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-219ENST00000587634 628 ntTSL 46.91□□□□□ -1.35e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.315e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 DOCK6-204ENST00000586482 352 ntTSL 36.31□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-221ENST00000588066 579 ntTSL 56.15□□□□□ -1.425e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-210ENST00000507688 422 ntTSL 55.8□□□□□ -1.484e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-202ENST00000413681 2951 ntTSL 25.71□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 44.08□□□□□ -1.765e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 ACAD10-221ENST00000550198 470 ntTSL 33.44□□□□□ -1.864e-6■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 NEDD4L-222ENST00000588494 505 ntTSL 42.62□□□□□ -1.995e-8■■■■□ 20.2
SRSF9Q13242 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.377e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.377e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-225ENST00000569487 2072 ntTSL 213.86□□□□□ -0.197e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.257e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 20
SRSF9Q13242 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.37e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.327e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.347e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 512.75□□□□□ -0.377e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.447e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.487e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.497e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.497e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.587e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.627e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.637e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 210.8□□□□□ -0.687e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-211ENST00000459851 480 ntTSL 310.75□□□□□ -0.697e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.737e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 510.45□□□□□ -0.747e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 210.37□□□□□ -0.757e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 410.33□□□□□ -0.767e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.777e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 210.2□□□□□ -0.787e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 49.96□□□□□ -0.827e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.827e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.847e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.847e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 39.7□□□□□ -0.867e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 EIPR1-209ENST00000462515 577 ntTSL 39.66□□□□□ -0.867e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-209ENST00000442878 909 ntTSL 59.56□□□□□ -0.887e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.887e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 39.33□□□□□ -0.927e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-212ENST00000478173 666 ntTSL 59.26□□□□□ -0.937e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-214ENST00000490050 942 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.937e-6■■■■□ 20
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