Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 AVT4YNL101W 2142 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 SPR1YOR190W 1338 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 FET4YMR319C 1659 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 HAC1YFL031W 717 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 YHR033WYHR033W 1272 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 CPT1YNL130C 1182 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 UBP13YBL067C 2244 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 PNS1YOR161C 1620 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 SNA3YJL151C 402 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 DCR2YLR361C 1737 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 STE3YKL178C 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 YJL043WYJL043W 774 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 PET10YKR046C 852 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 TCB1YOR086C 3561 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 FCY22YER060W-A 1593 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 AIM2YAL049C 741 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 CEF1YMR213W 1773 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 BRN1YBL097W 2265 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 RTC2YBR147W 891 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 YNL295WYNL295W 1575 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 POP1YNL221C 2628 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 PET494YNR045W 1470 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 RRP43YCR035C 1185 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 TPI1YDR050C 747 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 YDR476CYDR476C 675 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 INP54YOL065C 1155 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 MKK1YOR231W 1527 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG39Q06159 EFT2YDR385W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 EFT1YOR133W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 SKI2YLR398C 3864 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 SNF4YGL115W 969 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 FUS3YBL016W 1062 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YPC1YBR183W 951 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 HXK2YGL253W 1461 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 CTF8YHR191C 402 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 LOT6YLR011W 576 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 ERV25YML012W 636 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 AFG3YER017C 2286 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 HNM1YGL077C 1692 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 MSS51YLR203C 1311 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YCR041WYCR041W 333 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 PSA1YDL055C 1086 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YGR127WYGR127W 939 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 CAR2YLR438W 1275 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 ERV2YPR037C 591 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YIL055CYIL055C 1884 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YDR215CYDR215C 414 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 GET2YER083C 858 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 STS1YIR011C 960 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 DAL80YKR034W 810 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 VPS65YLR322W 315 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 PXL1YKR090W 2121 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 HXT15YDL245C 1704 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 HXT16YJR158W 1704 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 ALT2YDR111C 1524 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YLR112WYLR112W 420 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 YPT10YBR264C 600 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 ACS1YAL054C 2142 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 SPS1YDR523C 1473 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 LAG2YOL025W 1983 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG39Q06159 ARP3YJR065C 1350 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YDR327WYDR327W 327 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 THI4YGR144W 981 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 OPI1YHL020C 1215 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 NCA3YJL116C 1014 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YJR142WYJR142W 1029 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 KAE1YKR038C 1161 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YBL070CYBL070C 321 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 NUP84YDL116W 2181 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 KNS1YLL019C 2214 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 ECM38YLR299W 1983 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 BDF2YDL070W 1917 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 OSM1YJR051W 1506 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 PHO3YBR092C 1404 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 snR82snR82 268 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 NTG1YAL015C 1200 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 DSC3YOR223W 879 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YAH1YPL252C 519 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 CYB2YML054C 1776 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 RAP1YNL216W 2484 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 ISC1YER019W 1434 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 EDC2YER035W 438 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YGL260WYGL260W 231 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 PRY2YKR013W 990 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 CCP1YKR066C 1086 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YLR358CYLR358C 564 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 RIO1YOR119C 1455 nt5.68□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 FCY2YER056C 1602 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YGL081WYGL081W 963 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YKL147CYKL147C 618 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 BDS1YOL164W 1941 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 HRB1YNL004W 1365 nt5.67□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 HIS7YBR248C 1659 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 YBR241CYBR241C 1467 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 NMA2YGR010W 1188 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 MGM101YJR144W 810 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 MSI1YBR195C 1269 nt5.66□□□□□ -1.5
ATG39Q06159 SKP1YDR328C 585 nt5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.9 ms