Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFC1-1P60608 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFC1-1P60608 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFC1-1P60608 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms