Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
APLP1P51693 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APLP1P51693 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APLP1P51693 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
APLP1P51693 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
APLP1P51693 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APLP1P51693 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APLP1P51693 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APLP1P51693 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APLP1P51693 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APLP1P51693 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APLP1P51693 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APLP1P51693 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APLP1P51693 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APLP1P51693 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APLP1P51693 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APLP1P51693 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APLP1P51693 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APLP1P51693 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APLP1P51693 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APLP1P51693 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APLP1P51693 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APLP1P51693 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP1P51693 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP1P51693 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP1P51693 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP1P51693 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APLP1P51693 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP1P51693 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP1P51693 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APLP1P51693 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP1P51693 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APLP1P51693 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP1P51693 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP1P51693 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP1P51693 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APLP1P51693 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP1P51693 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP1P51693 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP1P51693 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP1P51693 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APLP1P51693 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP1P51693 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP1P51693 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP1P51693 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP1P51693 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APLP1P51693 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP1P51693 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP1P51693 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APLP1P51693 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APLP1P51693 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APLP1P51693 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
APLP1P51693 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APLP1P51693 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
APLP1P51693 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APLP1P51693 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APLP1P51693 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APLP1P51693 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APLP1P51693 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APLP1P51693 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APLP1P51693 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APLP1P51693 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APLP1P51693 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APLP1P51693 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APLP1P51693 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
APLP1P51693 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms