Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL28P46779 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL28P46779 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL28P46779 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL28P46779 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL28P46779 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL28P46779 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL28P46779 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL28P46779 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL28P46779 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL28P46779 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL28P46779 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL28P46779 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL28P46779 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL28P46779 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL28P46779 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL28P46779 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL28P46779 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL28P46779 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL28P46779 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL28P46779 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL28P46779 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL28P46779 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL28P46779 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL28P46779 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL28P46779 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL28P46779 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL28P46779 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL28P46779 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms