Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms