Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP1P28562 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP1P28562 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DUSP1P28562 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms