Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APCP25054 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APCP25054 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APCP25054 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APCP25054 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APCP25054 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APCP25054 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APCP25054 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APCP25054 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APCP25054 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APCP25054 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APCP25054 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APCP25054 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APCP25054 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APCP25054 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APCP25054 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APCP25054 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APCP25054 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APCP25054 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APCP25054 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APCP25054 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APCP25054 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APCP25054 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APCP25054 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APCP25054 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APCP25054 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APCP25054 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APCP25054 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCP25054 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCP25054 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCP25054 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APCP25054 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCP25054 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCP25054 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCP25054 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APCP25054 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APCP25054 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCP25054 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APCP25054 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APCP25054 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APCP25054 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APCP25054 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCP25054 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCP25054 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCP25054 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APCP25054 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APCP25054 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APCP25054 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APCP25054 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCP25054 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APCP25054 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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