Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1C1P21283 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1C1P21283 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1C1P21283 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1C1P21283 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms