Protein–RNA interactions for Protein: O14958

CASQ2, Calsequestrin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ2O14958 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASQ2O14958 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASQ2O14958 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASQ2O14958 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASQ2O14958 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms