Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF5O14894 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF5O14894 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF5O14894 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF5O14894 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF5O14894 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms