Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGM1P36871 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGM1P36871 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGM1P36871 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGM1P36871 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGM1P36871 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms