Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMG1C9JSJ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms