Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCSO14618 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCSO14618 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCSO14618 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCSO14618 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCSO14618 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCSO14618 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms