Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIF1AQ16665 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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